Tarina:Kolme Sanninia

Naruto ja Jiraiya palaavat Tsunaden ja Shizunen kanssa takaisin Konohaan, suostuteltuaan Tsunaden ryhtymään Konohan seuraavaksi Hokageksi Sarutobin kuoltua. Tehtävä Tee-maassa, eli jaksot 102-106, sekä jakso 97 ovat fillereitä.

• Jakso 97: Filleri jakso, jossa Naruto ja kumppanit käyvät kylpylässä matkalla Konohaan.
• Jakso 98: Ryhmä saapuu takaisin Konohaan, ja Tsunade aloittaa loukkaantuneiden parantamisen.
• Jakso 99: Konohamaru lukitsee itsensä Hokagen toimistoon ja Tsunade yrittää varmentaa Leen leikkauksen onnistumista.
• Jakso 100: Gai ja Lee muistelevat menneisyyttään, Tsunade julistetaan Konohan viidenneksi Hokageksi.
• Jakso 101: Hauska mangafilleri, jossa arvuutellaan mitä Kakashin maskin takana on.
• Jaksot 102-106: Naruto, Sakura ja Sasuke saavat uuden tehtävän. Tehtävä Tee-maassa on filleritarina.
• Jakso 107: Naruton ja Sasuken välinen taistelu.
• Jakso 108: Sasuke kadehtii Naruton kasvavia voimia, Sound-nelikko saapuu Konohaan.
• Jakso 109: Sasuken lähto Konohasta.