Tarina:Kolme Sanninia

Naruto ja Jiraiya palaavat Tsunaden ja Shizunen kanssa takaisin Konohaan, suostuteltuaan Tsunaden ryhtymään Konohan seuraavaksi Hokageksi Sarutobin kuoltua. Tehtävä Tee-maassa, eli jaksot 102-106, sekä jakso 97 ovat fillereitä.

• Jaksot 86-89: Naruton harjoittelu.
• Jakso 90: Jiraiya ja Naruto löytävät Tsunaden ja pyytävät tätä hokageksi.
• Jakso 91: Tsunaden muistelmat.
• Jakso 92: Tsunaden päätös Orochimarun käsien parantamisesta.
• Jaksot 93-96: Kolmen Sanninin taistelu.
• Jakso 97: Filleri jakso, jossa Naruto ja kumppanit käyvät kylpylässä matkalla Konohaan.
• Jakso 98: Ryhmä saapuu takaisin Konohaan, ja Tsunade aloittaa loukkaantuneiden parantamisen.
• Jakso 99: Konohamaru lukitsee itsensä Hokagen toimistoon ja Tsunade yrittää varmentaa Leen leikkauksen onnistumista.
• Jakso 100: Gai ja Lee muistelevat menneisyyttään, Tsunade julistetaan virallisesti viidenneksi hokageksi.